“地震之谜” 　阿尔金山大断层是引起中外专家和学者极大兴趣的地方。它的断裂带长达近千公里，宽数百公里，属走滑型活断层带。这样的断层区域理应频发较多的大地震，然而载于历史的地震记录却寥寥无几。是什么原因使这条因大地震而造成的断裂带，在以后的变迁中，却很少有地震在这里发生，相反地震却活跃于它以北的其他广阔地区以至阿尔泰山区呢？这是一个人们正在探索的谜。另外还有个现象：1906年玛纳斯县境内发生了8级地震，比起同级其他地区的地震带，其震中烈度、受震面积、破坏程度都小或低得多，并且竟没有发现地震断层。这在新疆地震史上也是一个有待揭示的谜。

“野马之谜” 　野马是世界上现存的唯一的野生马，曾经广泛分布在亚洲原野，据1985年的统计，现存于世界其他各国百余个动物园和养马场的6000多匹野马，都是上世纪末至本世纪初，从我国准噶尔盆地和蒙古西南边境捕捉去的少数野马的后裔。但是在这些野马的原产地，自1969年动物学家在蒙古最后一次见过它后，就再也没有发现它们的身影。我国近年曾进行多次调查（包括航空观察），虽发现了一些线索，但一直没有获得其存在的确定证据。于是，在野马故乡的原野上，是否还有野马生存，便成为动物学界的一大谜。我国学者对获得的情况经过综合分析后认为，如果还有野生马，其种群数量已十分稀少，并且正处于灭绝的边缘。它们的分布区已缩小到大致位于新疆北塔山以东的中蒙边境地带，约1万平方公里范围内。目前，为防止分布在其他各国的野马后裔严重退化，我国除正在执行国际性“野马还乡”计划外，寻找野生马的考察活动仍在深入进行，已获得野马头骨和皮张的标本。但新疆是否还有野马仍有待于人们去揭晓。

“新疆虎之谜” 　新疆虎是我国虎种的五个亚种之一。根据记载最初是从博斯腾湖附近获得它的标本，于1916年正式定名的。有记述说，新疆虎主要分布在塔里木河与玛纳斯河流域。但使人疑惑的是，迄今谁也没有真正见过或捕捉到它，也很少有它活动的消息。传闻50年代曾有牧民在塔里木河下游的阿尔干附近见到过虎，但因是传闻，其真伪无从证实。新疆到底有没有虎？新疆虎到哪里去了？对这些问题人们众说纷坛，一直找不到确切的答案。

“大红鱼”之谜 　新疆阿尔泰山密林深处的喀纳斯湖，环境幽静，景色秀丽，是一个物种资源丰富而独特的天然基因库。1985年7月新疆大学生物系的师生，在喀纳斯湖考察时，发现“大红鱼”并引起国内外轰动。“大红鱼”怎么会出现在海拔1370米的高山湖里？它们是怎样生活与繁殖的？引起了很多人的兴趣。“大红鱼”学名叫哲罗蛙（Huchotaimen），是在淡水生活的凶猛的冷水性名贵鱼种。它以鱼类为食，成年时体重可达70公斤，体型很大，因其身体在一定条件下呈现红色而得名。在我国仅见于额尔齐斯河水系和黑龙江水域。据喀纳斯湖的考察者记述：“我们估计，喀纳斯湖的‘大红鱼'一般长3一5米，最大的可达10多米。这种‘大红鱼'，在整个喀纳斯湖可能有数百条”。据当地传说：30年代，有人钓上一条大鱼，17匹马也没有将它的肉驮完，鱼的鳃盖可以盖上一口大锅。这些记述和传说，更给喀纳斯湖“大红鱼”罩上了一层神秘、传奇的色彩。喀纳斯湖红鱼的真实情况究竟怎样，还有待进一步探明。

“雪人”之谜 　世界上有“雪人”吗？目前对“雪人”的了解还处于传说阶段，谁也没有得到并提供出“雪人”存在的确凿证据。新疆也有关于“雪人”的传说：据说50年代在乌拉泊水库工地，有人见过“雪人”；60年代在昆仑山，解放军战士曾见过几个“雪人”在一起走动，并向它们开了枪，但它们似乎是刀枪不入；1984年的《乌鲁木齐晚报》报道：有人在东昆仑山上见过“雪人”的足迹。新疆是否真有“雪人”？真实情况目前还不为人知，但一直是人们津津乐道又悬而未决的问题。

“游移湖”之谜 　在被人们视为死亡地带的罗布荒漠腹地，有一片神秘的湖泊，它就是世界闻名的罗布泊。罗布泊在中国古代曾被称为“幼泽”、“盐泽”“蒲昌海”和“牢兰海”。元朝以后称为“罗布淖尔”。但这样一片众河汇聚的海洋水泊，它的具体地理位置，在国际地理学界却持续争论了半个多世纪之久。20世纪初瑞典探险家斯文赫定认为罗布泊是一片捉摸不定的湖泊，他给它起了一个名字叫“游移湖”。罗布泊究竟是不是一座“移动不定”的湖泊？它为什么会游移不定，学术界至今仍意见纷纭。